Die von Subversion verwalteten Elemente werden auf dem Server in einer Datenbank abgelegt. Subversion merkt sich die Dateien, die unter Versionsverwaltung stehen in lokalen Verzeichnissen mit dem Namen ".svn". Beim verschieben oder kopieren von lokalen Elementen kann man durch kopieren der, in der Regel, nicht sichtbaren .svn-Verzeichnisse Inkonsistenen erzeugen, die ein einchecken der Daten erschwert. Daher sollte stets mit svn copy bzw svn move gearbeitet werden.
